Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms