Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms