Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNT1Q5JUK3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNT1Q5JUK3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNT1Q5JUK3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNT1Q5JUK3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNT1Q5JUK3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms