Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms