Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms