Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms