Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDCA8Q53HL2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA8Q53HL2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms