Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms