Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HFEQ30201 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HFEQ30201 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HFEQ30201 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HFEQ30201 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms