Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHQ16836 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HADHQ16836 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms