Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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