Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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