Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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