Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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