Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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