Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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