Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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SLAMF1Q13291 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLAMF1Q13291 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SLAMF1Q13291 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLAMF1Q13291 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms