Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN3Q13064 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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