Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECH1Q13011 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms