Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXO1Q12778 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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