Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALD1Q05682 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms