Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MC1RQ01726 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms