Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT85P78386 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT85P78386 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT85P78386 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT85P78386 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT85P78386 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT85P78386 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT85P78386 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT85P78386 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT85P78386 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms