Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF6P62330 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF6P62330 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF6P62330 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms