Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms