Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME5P56597 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME5P56597 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME5P56597 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME5P56597 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms