Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAG2P55895 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAG2P55895 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms