Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGF8P55075 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGF8P55075 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms