Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms