Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRATP43155 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRATP43155 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRATP43155 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRATP43155 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRATP43155 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRATP43155 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms