Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBRP36941 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms