Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT2P35908 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT2P35908 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT2P35908 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms