Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms