Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCAP28676 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCAP28676 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCAP28676 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms