Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXP28300 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXP28300 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXP28300 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms