Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms