Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms