Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms