Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms