Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XBP1P17861 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XBP1P17861 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XBP1P17861 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XBP1P17861 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XBP1P17861 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XBP1P17861 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XBP1P17861 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms