Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL2P13500 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL2P13500 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL2P13500 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms