Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms