Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms