Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms