Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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