Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNP07948 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNP07948 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNP07948 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNP07948 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYNP07948 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYNP07948 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms