Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERPIND1P05546 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERPIND1P05546 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms