Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD74P04233 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD74P04233 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD74P04233 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms