Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms