Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRY3O43610 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms